Sunjaya Putra lahir di Bandung pada 2 Juli 1969 dan telah menyelesaikan pendidikan dasar hingga sekolah lanjutan pertama di Lembang. Kemudian pada tahun 1994, Sunjaya menyelesaikan pendidikan kesarjanaannya di UNPAD jurusan Hama dan Penyakit Tumbuhan.

Sunjaya mengawali karir sebagai peneliti di Kementerian Pertanian pada tahun 2007 di Satker BPTP Jawa Barat. Sunjaya mulai bergabung di Balittri pada tahun 2015 menambah daftar SDM handal dan profesional Balittri di Kelti Ekofisiologi dan Teknologi Benih.